それはともかく
意味
こそあれ
（１）～はあるけれど、～ ＊「あり」が本動詞
（２）～であるけれど、～ ／ ～ているけれど、～ ＊「あり」が補助動詞
こそあらめ
（１）～はよいだろうが、～
（２）～はともかく（かまわないが・仕方がないが）、～
（３）～がよいだろう・～するのがよい ＊文末表現
（未然形）ばこそあらめ
（１）（～なら）ばよいだろうが、～
（２）（～なら）ばともかく（かまわないが・仕方がないが）、～
ポイント
「こそあれ」は、係助詞「こそ」＋動詞「あり」の已然形です。
「こそー已然形」は、後件につながっていく場合は「～けれど」という逆接のかたちで訳すことになります。「こそあれ」という言い回しはほとんどこの使い方です。
「こそあれ」は、「あり」が本動詞なら「～はあるけれど」と訳し、「あり」が補助動詞なら「～であるけれど・～ているけれど」などと訳します。
それに推量の助動詞「む」がついたものが「こそあらめ」ですね。
どうして「こそあれ」は「あるけれど」なのに、「む」がつくと、「よいだろうけど」って訳すの？
「よい」はどこからきたの？
「こそあれ」の場合は、「あること」がすでに確定していて、そもそも事実なので、「良い悪い」の次元ではなく、シンプルに「あるけれど」となります。
それに対して、「こそあらめ」の場合は、「あるだろう」と推量していることになります。「む」という助動詞は「主観的な推量（意志）」を示すので、「こうだったらいいなあ」とか「やだなあ」という「気持ち」が入りやすいのですね。どちらかというと、「こうだったらいいなあ」という「希望的観測」のほうが多いです。
したがって、「ある」という状態について、「あるといいんだけど、（ないなあ）」とか、「Aがあるのはかまわないけど、（Bはあってほしくない）」とか、「気持ち」が入った訳になりやすいのです。
その「ある」という状態について、多くの場合「～は（あるのが）よいけれど」または「～は（あっても）よいけれど」というニュアンスになります。後者の場合は、「～はともかく（として）、」と訳すことも多いですね。
ああ～。
「雨がふってもいいけれど、雪はいやだ」なんて言う場合、
「雨はともかくとして、雪はいやだ」とか、
「雨は仕方ないが、雪はいやだ」とか、
「雨はかまわないが、雪はいやだ」とか、
いろんな言い方があるもんね。
そうですね。
その状況を肯定的に認めているのであれば「～はよいだろうが、」となります。
「肯定まではしていないけれど別にあってもいい」くらいに思っていれば「～はともかく・仕方ないが・かまわないが」という訳になりますね。
結局「後ろ」次第で適訳を考えていくしかないんだな。
それに「ば」がついた「ばこそあらめ」も似たような感じなのかな。
「未然形＋ば」がつく用法なので、「仮定条件」になります。
「こそあらめ」は「体言」につきやすくて、その「物体など」が「ある」ことを想定していますが、「ばこそあらめ」の場合は「未然形」のところが用言や助動詞になりますので、なんらかの「動き・状態」などが「ある」ことを想定しやすいです。
「ばこそあらめ」は「仮定条件」ですから、「～ならばよいだろうが」「～すればともかく」など、仮定的に訳しましょう。
あとは、そんなに多くないですけれど、後件の内容次第では、「～だったらいやだけど、そうじゃないから大丈夫」という感じで、「～だったらぐあいが悪いが」と訳すこともあります。
結局「後ろ」次第で適訳を考えていくしかないんだな。
そうですね。
「こそあらめ」「ばこそあらめ」などは、「逆接」の後ろの内容を読解しないと訳せないですね。
例文
中垣こそあれ、ひとつ家のやうなれば、（土佐日記）
（訳）隔ての垣根はあるけれど、ひとつの家のようであるので、
今こそあれ 我も昔は 男山 栄行くときも ありこしものを（古今集）
（訳）今でこそ衰えているけれども、（気力体力が）盛んな時もあったものなのに。
表現としては「今でこそ〇〇ているが」ということを言っています。
何かの「物」が「存在する」と言っているわけではないので、この「〇〇」のところに意味的には「おとろへて」などの動詞があって、「あり」は補助動詞として使われていると考えます。言わなくてもわかるから書かれていないのですね。
逆接でつながる「うしろ」に、「栄行くときがあった」とあるので、そこをヒントに解読することになります。
桜もやうやう気色だつほどこそあれ、をりしも雨風うちつづきて、（徒然草）
（訳）桜の花もだんだん咲き出すころであるけれど、ちょうどその折、雨風が続いて、
「あり」の直前に動詞があるわけではありませんが、何かの「物」が「存在する」と言っているわけではないので、補助動詞と考えます。
思ひ出でて偲ぶ人あらんほどこそあらめ、そもまたほどなく失せて、聞き伝ふるばかりの末々は、あはれとや思ふ。
（訳）（故人を）思い出して懐かしむ人がいるうちはよいだろうけれど、そんな人もまたすぐに亡くなって、（故人のことを）聞き伝えるだけの子孫たちは、しみじみと懐かしむだろうか、いや、懐かしむまい）。
これへ迎へ参まゐらせて、一つ所にていかにもならばやとは思へども、我が身こそあらめ、御ためいたはしくて。（平家物語）
（訳）これ（都にいる平維盛の妻のもと）へ迎えを参上させて、（維盛と）同じところでどうにでもなりたいとは思うけれども、自分【維盛】の身はそれでかまわないが【自分の身はともかく】、（妻の）ためにはかわいそうで。
「いかにもいかにも心にこそあらめ。」（更級日記）
（訳）「どのようにもこのようにも（あなたの）心のままにするのがよい。」
「こそあらめ。」で文末表現になっている場合は、一種の強調と考えて、「～だよいだろう」「～するのがよい」などと訳します。
会話に出てきて、二人称に対して用いるので、この場合の「め」は「適当・勧誘」の意味になります。
などか助け給はざらん。高き位を求め、重き宝を求めばこそあらめ、ただ今日食べて、命生くばかりの物を求めて賜べ。（古本説話集）
（訳）（観音様は）どうして（私を）お助けにならないのだろう。（私が）高い位を求め、重い宝を求めるならば（お助けにならなくても）仕方がないが、ただ今日食べて、命が助かる程度の物を探してお与えください。
「何かは、今はじめたることならばこそあらめ、ありそめにけることなれば、さも心交はさむに、似げなかるまじき人のあはひなりかし」とぞ思しなして、咎めさせたまはざりける。（源氏物語）
（訳）「どうして、今に始まったことならば支障があるだろうが（ぐあいが悪いだろうが）、前から続いていることなので、そのように心を交わすとしたら、それもおかしくはないはずの人の仲であるよ」とお考えになって、お咎めにならなかった。
文脈的に、「～であったらダメだけど、そうじゃないからいいよ」という意味合いになります。
ただ、これは文意を先取りして「咎めることもあるだろうけれど／咎めてもよいだろうけれど」と訳しても問題ありません。